潭柘寺之所以出名，除了因为它是清代的皇家寺院外，还因为它有四件宝物，那么是哪四件宝物呢？据寺中僧人说，潭柘寺的四件宝一是被称为潭柘寺的开山祖师华严禅师的画像；二是原三圣殿西供奉的药师佛像；三是大雄宝殿里的两根“自由柱”；四是龙王殿檐下挂着的石鱼。然而，遗憾的是，潭柘四宝，人们现在只能看到石鱼了。
石鱼现悬挂在龙王殿廊檐下，长1.5米，重75公斤，呈紫铜颜色，从远处看像真鱼一样，用小木锤敲击石鱼的不同部位，就会发出不同的“叮咚”悦耳的声音，而且音阶上也有明显的变化，如同敲击乐器。据寺内的僧侣讲，这个石鱼是天赐之物，这又从何说起呢？
传说石鱼是南海龙王的心爱之物，每逢庆典时候，龙母都敲击它奏乐，这种美妙的乐声传到天宫中去了，王母娘娘听见了，非常喜欢这种乐声。龙王知道后，趁着王母娘娘过生日时，就将石鱼献给了王母娘娘，可当王母娘娘敲击它时，却发不出声音来，王母娘娘很不高兴，就问太上老君：“这是何等宝物，怎么我敲击它就不出声音呢？”太上老君回答道：“这是下界之物，怎么能供到天上来呢？还是还回去吧。”王母娘娘又舍不得，于是就将石鱼放在瑶池中，它还能自由自在的游动。
这一年，我国北方天遇大旱，从春到夏，未下一滴雨，河水断流，禾苗都枯竭而死，就连人们赖以生存的水井也快见底了。人畜渴死的，病死的，一天比一天多，老百姓也没有办法，他们只能求神拜佛，祈求龙王赐场救命雨。这时，人间降灾的消息传到天宫，玉皇大帝知道后，想起瑶池中的石鱼有呼风唤雨、除病灭灾的本领，就急忙降旨把这条鱼从瑶池取出来，赐给下苍以解人间苦难。
在一天夜里，狂风大作，雷电交加，突然一道闪电，“刷”地一道白光从天而降，落在了潭柘寺大雄宝殿前的台基上，打更守夜的僧人听到院中“咕咚”一声响，心中一惊，赶忙举灯前去查看，原来是从天上降下一物，仔细一瞧，是一条被摔得模糊不清的石鱼落在院中。众僧人连忙将这个消息告知方丈，老方丈知道是上天所赐。于是，让工匠按照鱼形进行精雕细刻，恢复其本来面目。
令人惊奇的是，随着工匠锤凿，钎子一打在上面，就发出清脆悦耳的声音。而随着不断传出的“叮当”声，火辣辣的天气竟然渐渐地变得凉爽起来，紧接着天空阴云密布，当宝鱼现出原形时，大雨早已哗哗地下起来。这雨下了三天三夜，水涨河满，大地复苏，人畜得救了。后来，人们发现石鱼身上有13个部分，代表着中国过去南七北六13个州，也就是13个省，于是众僧把这条鱼挂在寺内龙王殿前的廊檐下，以后不管哪个州遇上旱灾，人们就敲击石鱼的哪个地方，遇灾的地方就会降雨。传说石鱼是天宫之物，据考据学家证实的确有它的道理，因为它本身就是一位天外来客，石鱼是一块含铜量较高的陨石。
潭柘寺石鱼求雨是异常灵验的，相关史料记载，到潭柘寺求雨，只要寺庙所在地一下雨，北京城就必定下雨。潭柘寺求雨为什么灵验呢？难道寺中的石鱼真有呼风唤雨、除病灭灾的本领？据有关专家考证，这是由于潭柘寺的地理位置十分有特色，潭柘寺上空的等高线与北京城区的等高线形成了一个很有规律的曲线，当潭柘寺开始下雨时，北京城里还没有下雨，可当人从潭柘寺走到城里时，雨则刚刚降临。于是，这一现象就被人们说成是潭柘寺求雨的灵验。
寺僧说潭柘寺有四宝，但现在人们除了看到龙王殿檐下挂着的石鱼仍然挂在那里以外，其他三宝则已经不知去向。目前，对三宝的去向说法不一。不过比较可靠的说法是，在康熙三十一年时，潭柘寺曾经发生过一次大火，而潭柘寺的三宝在这次大火中被销毁。